Какие налоговые льготы доступны для резидентов Сколково в 2025 году: освобождение от НДС и другие преференции

Участники Сколково получают широкий спектр государственных преференций, включая налоговые льготы. Эти меры позволяют бизнесу сбалансировать финансовые расходы и перераспределить ресурсы на развитие компании.

Рассказываем, кто может стать участником проекта, каким требованиям нужно соответствовать, как получить освобождение от некоторых налогов, а также чем грозит потеря резидентства.

Что такое Сколково и какие преимущества дает резидентство

Инновационный центр «Сколково» — особая экономическая зона, которую создали в 2010 году в Подмосковье. Главная его миссия заключается в поддержке инновационных стартапов в России.

Статус резидента Сколково открывает юрлицам доступ к обширному набору преимуществ:

• налоговым льготам (освобождение от уплаты ряда налогов, сниженный тариф по страховым взносам);

• развитой инфраструктуре технопарка (возможна аренда помещений по сниженной цене, сопровождение научно-исследовательских работ на специальных условиях);

• репутационному эффекту участника Сколково (значок Sk, положительное влияние на имидж, признание разработок и доверие партнеров);

• привлечению инвестиций в рамках связей с венчурными фондами, корпоративными инвесторами и т. д. (поддержка в сборе документов, проведении переговоров);

• международному сотрудничеству с научными организациями (участие в программах акселерации, менторская поддержка, обучение сотрудников);

• грантовой поддержке (софинансирование проектов, испытаний, участие в конференциях и т. д.);

• льготным условиям привлечения иностранных сотрудников (отменено квотирование для иностранных работников, увеличены сроки действия разрешительных документов, доступны визово-миграционные льготы);

• финансовой компенсации таможенных пошлин (полное возмещение таможенных сборов);

• участие в мероприятиях Сколково (установление деловых связей во внутренней среде Фонда, выход на крупные компании в соответствующей сфере, повышение своих компетенций).

Требования к участникам Сколково

Для получения статуса резидента центра необходимо соответствовать требованиям законодательства. Правовое регулирование деятельности участников Сколково осуществляется в соответствии с законом № 244-ФЗ, а также иными правовыми актами. Согласно законодательству резиденты должны:

• Быть зарегистрированы на территории РФ.

• Заниматься созданием и внедрением инновационных технологий в сферах IT, биотехнологий и т. д.

• Осуществлять исключительно исследовательскую деятельность и коммерциализацию ее результатов.

• Пройти экспертную оценку проекта, включающую рассмотрение его экономической эффективности и потенциала роста.

• Предоставить документальные подтверждения участия в инновационных стартапах.

• Зарегистрироваться в Инновационном центре.

В ближайшем будущем планируется дальнейшее совершенствование нормативно-правовой базы Сколково. Эти изменения направлены на повышение экономической эффективности работы экономической зоны и оптимизацию существующих механизмов поддержки инновационных компаний.

В 2025 году для сохранения резидентства и оформления льгот в части налогообложения организациям нужно соответствовать следующим требованиям:

1. Инновационная направленность должна быть приоритетной для бизнеса.
2. Долевое соотношение инновационной продукции в общей выручке должно соответствовать действующим нормативам.
3. Электронный документооборот, в том числе бухучет должны вестись в цифровом формате.
4. Ежегодная отчетность перед наблюдательным советом Сколково должна включать: cписок созданных инновационных продуктов, данные о вложениях в научно-исследовательские и опытно-конструкторские работы (НИОКР), а также информацию о полученных патентах.

Важный аспект — усиление контроля налоговиков за применением льгот участниками Сколково. В связи с этим особое значение приобретает качественное ведение бухгалтерского и налогового учета в новых условиях регулирования. Законы в отношении налоговых льгот регулярно меняются. Бизнес часто упускает выгоду, потому что нет ресурсов на мониторинг законодательных изменений, а руководители погружены в операционную деятельность и не могут из нее вынырнуть для полноценной проработки нововведений.

Мы придерживаемся проактивной позиции — не просто отвечаем на запросы клиентов, но и сами выступаем с инициативой. У нас работает целый отдел методологов и аудиторов, которые следят за нововведениями и дают ценные рекомендации. С 1C-WiseAdvice вы будете всегда будете в курсе последних изменений НК РФ, новых региональных и федеральных инициатив, а также отраслевых мер поддержки бизнеса.

Налогообложение участников проекта Сколково

Участники Сколково могут выбрать ОСНО, УСН или ЕСХН для ведения бизнеса. Все резиденты обязаны платить:

• НДФЛ как налоговые агенты;

• общие страховые взносы и взносы на травматизм, однако по общим взносам доступны такие же льготы, как и для субъектов малого и среднего предпринимательства (МСП).

В отдельных случаях юрлица выступают налоговыми агентами по НДС, соответственно уплачивая и этот налог. Рассмотрим, какие налоги уплачивают на каждой системе налогообложения.

Какие налоги установлены для участников Сколково на ОСНО

Фирмы, применяющие ОСНО, платят:

• налог на прибыль по ставке 0% вместо 20%;

• НДС при реализации по ставке 0% вместо 20%;

• НДС при импорте;

• иные налоги при наличии объектов налогообложения.

Условия получения преференций рассмотрим ниже.

Какие налоги платит резидент Сколково на УСН

Юрлица, выбравшие УСН в Сколково, платят:

• НДС по ставке 0% вместо 20% (п. 1 ст. 145.1 НК РФ);

• налог на имущество по ставке 0%;

• налог на транспорт и землю, если есть объекты налогообложения.

Существуют два варианта освобождения от НДС для резидентов на УСН в Сколково:

• Освобождение по умолчанию, если заработок фирмы за год не превышает 60 млн ₽;

• Специальное освобождение для участников Сколково при превышении установленного лимита доходов. То есть если компания превысила лимит в 60 млн ₽, она может получить освобождение от налога при определенных условиях.

Налоги участников Сколково на ЕСХН

Юрлица на ЕСХН платят:

• налог на ЕСХН по общей ставке — освобождение от налога для резидентов не предусмотрено;

• НДС, если доход компании превышает 60 млн ₽ в год;

• налоги на землю и транспорт, если есть объекты налогообложения.

Налоговые льготы резидентов Сколково

Юрлицам доступны льготы резидентов Сколково. На время резидентства (10 лет) их освобождают от уплаты:

• налога на прибыль компании (0% вместо 20%) по п. 1 ст. 246.1 НК РФ;

• НДС при реализации продукции, связанной с инновациями (0% вместо 20%). Исключение — импортируемые товары;

• имущественного налога (0%);

• местных налогов.

Также участники экономической зоны уплачивают страховые взносы на льготных условиях (как для МСП).

При этом льготы редко используются для регулирования налоговой нагрузки компании. Для того чтобы правильно применить льготу, нужно разобраться в реестрах, уточнить условия, при которых предоставляются преференции, и грамотно оформить документы. Чтобы точно использовать все доступные бизнесу льготы, выгоднее обратиться к профильным налоговым консультантам.

Какие льготы по налогу на прибыль есть для участников Сколково

Фирмы вправе получить освобождение от налога на прибыль. Эта льгота резидентов Сколково доступна при применении ОСНО и начинает действовать с 1-го числа месяца, который идет за месяцем получения статуса участника (п. 4 ст. 246.1 НК РФ).

Период предоставления льготы — 10 лет. По окончании срока освобождение теряется безвозвратно (Письмо Минфина № 03−00−07/88 070 от 13.09.2024). Повторное предоставление льготы при очередном установлении статуса резидента невозможно.

По завершении налогового периода фирма вправе пролонгировать действие льготы или отказаться от нее. Однако при непредставлении налоговикам документов в срок или подаче некорректных данных потребуется восстановить и уплатить неуплаченный налог и нужно будет заплатить пени.

В этом случае утрата льготы резидента Сколково будет временной. Освобождение можно вновь получить после подачи налоговикам исправленных данных.

Как сообщить об освобождении. Для применения льготы резидента Сколково в 2025 году фирма обязана предоставить (п. 4, 7, 8 ст. 246.1 НК РФ, ч. 12 ст. 8 176-ФЗ от 12.07.2024):

• уведомление об освобождении, утвержденное приказом ФНС. В строке «Сообщаю» укажите код «1»;

• подтверждение резидентства в Сколково;

• отчет о финрезультатах.

Подать документы необходимо до 20-го числа месяца, следующего за месяцем начала действия льготы.

Как продлить срок льготы. Для пролонгации льготы резидентам Сколково в следующем году потребуется предоставить до 20 января:

• уведомление о продлении. Направьте ту же форму, но в строке «Сообщаю» укажите «2»;

• подтверждение резидентства в Сколково;

• отчет о финрезультатах.

Документы подайте любым удобным способом: в бумажном виде, онлайн или отправьте почтой.

Как оформить отказ от льготы. Вы можете оформить отказ от льготы по налогу на прибыль как резиденту Сколково после окончания года, в котором действовало освобождение (Письмо Минфина № 03−03−06/1/98 497 от 11.10.2024). Чтобы начать платить налог — подайте до 20 января:

• уведомление об отказе (форма из приказа ФНС);

• подтверждение резидентства;

• отчет о финрезультатах.

Потеря права на льготу резидента Сколково

Участники могут лишиться льготы по следующим причинам (п. 2 ст. 246.1 НК РФ):

• Потеря статуса. В этом случае юрлицо восстанавливает налог за весь год и уплачивает его с пенями.

• Превышение выручки за год в 1 млрд рублей. Льгота аннулируется с начала года, в котором выявлено превышение. Прибыль до 300 млн ₽ облагается по ставке 0%, далее налог с дохода считают по общим правилам. Потребуется его восстановление и уплата налога вместе с пеней.

Льгота по налогу на прибыль в Сколково — значимая преференция для юрлиц, требующая строгого соблюдения порядка уведомления и контроля целевых показателей. Наличие льгот усложняет ведение бухучета, требует выбора подходящего налогового режима и своевременной подачи пакета документов.

Ошибки в отчетности в Сколково для резидентов, некорректное оформление документов и нарушение сроков приводят к существенным штрафным санкциям. Чтобы этого избежать, доверьте ведение учета 1C-WiseAdvice — у нас есть опыт обслуживания резидентов Сколково. В работе с такими клиентами мы придерживаемся подхода «Бухгалтерия с пользой для бизнеса». Мы предоставляем качественные финансовые данные для отчета Сколково, можем собрать информацию заранее для квартальных отчетов в ответ на запрос клиента. Если проверяющие в Сколково будут недовольны, мы подключимся, вникнем и исправим проблему, если сможем.

Какие действуют льготы по НДС в Сколково

Резидентам доступно освобождение от НДС по большинству операций. Оно предоставляется на 10 лет (п. 1 ст. 145.1 НК РФ) при подаче уведомления на использование льготы и применяется с 1-го числа месяца, следующего за месяцем получения статуса резидента (п. 3 ст. 145.1 НК РФ). Льгота доступна для предприятий на ОСНО и УСН.

Как сообщить об освобождении от НДС. Чтобы воспользоваться освобождением от НДС для резидентов Сколково — сообщите об этом ИФНС. Для этого предоставьте:

• уведомление об освобождении;

• подтверждение резидентства;

• отчет о финрезультатах.

После получения льготы вы вправе продлить действие преференций или отказаться от них.

Как продлить льготу по НДС в Сколково. Механизм аналогичен оформлению освобождения по налогу с прибыли организации. Каждые 12 месяцев подавайте налоговикам:

• уведомление об освобождении;

• подтверждение статуса;

• отчет о финрезультатах.

Срок подачи — до 20 января. С каждого нового года требуется подача уведомления и документов для продления.

Как оформить отказ от освобождения по НДС. Отказ от льготы по НДС в Сколково возможен только через 12 месяцев после начала ее использования. Для его оформления подайте уведомление до 20-го числа следующего месяца.

Когда возникает потеря права на освобождение от НДС

Действие освобождения от НДС прекращается для участников проекта Сколково, если (п. 2 ст. 145.1 НК РФ):

• потерян статус резидента;

• истекло 10 лет со дня включения юрлица в реестр;

• превышены финансовые лимиты.

Какие льготы по налогу на имущество есть для участников проекта Сколково

Фирмы на УСН или ОСНО освобождаются от имущественного налога на 10 лет без необходимости ежегодного подтверждения или продления льготы в ИФНС (п. 28 ст. 381 НК РФ, Письмо Минфина № 03−00−07/88 070 от 13.09.2024). Преференция действует, начиная с 1-го числа месяца, идущего за постановкой имущества на учет. Для подтверждения льготы нужно предоставить в налоговые органы документы, подтверждающие статус резидента, и данные о доходах и расходах компании.

Льгота становится недоступной в тех же случаях, что и по НДС. Если юрлицо восстановит статус участника — оно вправе возобновить использование льготы.

Льготы по страховым взносам для резидентов Сколково

Пониженные тарифы действуют для резидентов, начиная с 1-го числа месяца, в котором они получили статус участника Сколково (пп. 10 п. 1, п. 9 ст. 427 НК РФ).

Отметим, что с 2025 года в НК РФ внесли изменения законом № 362-ФЗ. Нововведения затронули механизм применения пониженных ставок страховых платежей для представителей малого и среднего предпринимательства и резидентов. Расчет взносов теперь напрямую связан с МРОТ — пониженные тарифы теперь применяют только к той части выплат, которая превысила 1,5-кратный размер этого показателя.

Такой же алгоритм расчета используют для предприятий, занятых в сфере обрабатывающих производств. Последние рассчитывают взносы по ставке 7,6% вместо 15%. Налоговики усиливают контроль за правомерностью применения этих бонусов. Они доступны, если резиденты минимум 50% своих расходов направляют на НИОКР и не занимаются сдачей объектов в аренду и торговлей.

Для участников центра предусмотрены пониженные тарифы страховых взносов — 15% для выплат работникам сверх 1,5 МРОТ. Преференция начинает действовать с 1-го числа месяца, следующего за месяцем установления статуса, и сохраняется 10 лет без необходимости продления. По окончании этого срока она автоматически прекращается даже при повторном подтверждении резидентства.

Как работает льгота (п. 2.4 ст. 427 НК РФ):

• 15% — на платежи свыше 1,5 МРОТ;

• 30% — на платежи в пределах 1,5 МРОТ.

Льгота прекращается в тех же случаях, что и по НДС.

Стоит отметить, что резиденты обязаны платить взносы на травматизм, никаких льгот здесь не предусмотрено. Тариф зависит от класса профессионального риска предприятия — от 0,2% до 8,5%.

Особенности налоговой отчетности участников Сколково

Участники Сколково ведут отчетность в соответствии с выбранным налоговым режимом: ОСНО, УСН или ЕСХН. Однако в сдаче отчетов для резидентов есть свои особенности:

1. С 2025 года отчетность сдают исключительно в электронной форме. Документы должны быть заверены усиленной квалифицированной электронной подписью.
2. В отчетности обязательно должны быть отражены все положенные льготы.
3. Если юрлицо применяет льготу по НДС и налогу на прибыль, подавать декларации по ним не нужно.
4. Если у резидента налог на прибыль 0%, то после окончания льготного периода декларацию сдают до 25-го числа месяца, следующего за отчетным периодом.
5. Если у предприятия есть объекты налогообложения по имущественному налогу — декларацию подают каждый год до 25 февраля, даже при наличии льготы.
6. Если участник Сколково не является налоговым агентом по НДС, но выписывает счета-фактуры — вместо декларации требуется подавать журнал учета счетов-фактур до 20-го числа месяца, который следует за отчетным кварталом.
7. Декларации по транспортному и земельному налогам подаются только в случае, если у фирмы есть в собственности транспортные средства или земельные участки.

Последствия при потере статуса резидента Сколково

Участники Сколково теряют право на преференции с момента утраты своего статуса (письма Минфина № 03−07−07/18 457 от 11.03.2020, № 03−01−10/1528 от 15.01.2020):

• налог на прибыль — льгота отменяется с начала года, в котором фирма лишилась статуса;

• НДС — послабления перестают действовать с 1-го числа квартала, в котором было потеряно резидентство;

• страховые взносы — сниженный тариф действует до 1-го числа месяца, следующего за месяцем исключения из реестра.

Таким образом, утрата статуса влечет поэтапное восстановление налоговой нагрузки. Компаниям важно учитывать сроки и правила для каждого вида обязательств, чтобы минимизировать риски.

Льготы по таможенным платежам

Участники Сколково вправе получить компенсацию 100% расходов на таможенные платежи, в том числе таможенную пошлину и НДС. Отметим, что товары, которые ввозят из-за границы, должны быть необходимы для исследований и последующей коммерциализации инноваций компании.

Для оформления возмещения резидентам необходимо подготовить такой комплект документов:

• договор о компенсации расходов между резидентом и Фондом «Сколково»;

• договор о предоставлении услуг — с таможенным представителем Сколково;

• уведомление об импорте товаров с детальным описанием их назначения (требуется предварительное согласование с Фондом «Сколково»).

Процедуру декларирования товаров, в отношении которых ожидается компенсация расходов, проводит ООО ТФК «Сколково». При этом резидент самостоятельно несет расходы на оплату затрат за таможенное оформление.

Таможенный представитель осуществляет мониторинг целевого использования импортированной продукции. В случае выявления фактов нецелевого применения резиденту необходимо будет вернуть выделенное возмещение в течение 5 лет с даты ввоза. Нарушение данного условия грозит лишением статуса и льгот.

Дополнительные льготы для IT-компаний

IT-компаниям с аккредитацией Минцифры помимо стандартных льгот резидентов центра доступны дополнительные преференции:

• налог на прибыль — 5%;

• отсрочка от мобилизации для IT-специалистов;

• грантовая поддержка (софинансирования проектов до 80%);

• кредитные программы под 3% годовых;

• специальные условия по найму иностранных специалистов (отмена патента и разрешения на работу);

• возможность принимать участие в госзакупках.

Кроме того, таким организациям предоставляется возможность использовать пониженные тарифы страховых взносов. С 2025 года произошли важные изменения. Теперь тариф 7,6% применяют к полной сумме выплат работникам, без выделения сумм, превышающим лимит базы.

Чтобы получить льготы, надо соответствовать двум критериям:

1. Аккредитация в Минцифры — подтверждение IT-специализации компании.
2. Доля дохода от IT-деятельности — более 70%.

В свою очередь для аккредитации Минцифры потребуются:

• Согласие на раскрытие налоговой тайны.

• Сведения на сайте юрлица: должно быть указано, что она входит в число IT-компаний.

• Основной ОКВЭД «62 — разработка программного обеспечения».

• Доля профессиональной выручки — не менее 30%.

Критерии подтверждения источников IT-доходов

Чтобы у налоговой службы не возникло вопросов в отношении вашего дохода от IT-деятельности, нужно четко понимать, что 70% IT-дохода составляют поступления:

• от разработки собственного ПО (включая модули и обновления);

• от технической поддержки и обучения пользователей;

• от продажи лицензий на программные продукты.

Это необходимо подтверждать документами:

• техническими заданиями;

• договорами с клиентами;

• актами выполненных работ;

• отчетами о внедрении решений.

Недопустимо включать в расчет доходы от перепродажи стороннего софта. В договорах необходимо указывать, что ваша IT-компания предоставляет клиенту лицензию на использование вашего ПО. Важно подтвердить собственную разработку софта и сервисов, связанных с ним. Нарушение условий ведет к лишению аккредитации Минцифры.

Подробнее о льготах для IT-компаний в 2025 году и изменениях 2026 года рассказали в статье.

Запрет применения льгот по разным основаниям с 2026 года

В 2025 году льготы от резидентства Sk можно одновременно сочетать с иными преференциями, в том числе и для фирм, занятых в IT-сфере. Например, они вправе не платить налог с прибыли, являясь участником проекта Сколково, и платить страховые взносы по пониженному тарифу как аккредитованная Минцифры IT-компания. Так можно воспользоваться сразу двумя льготами одновременно.

В 2026 году эту возможность запретят (законопроект № 1 026 190−8). В частности будет нельзя совмещать льготу по взносам для IT и льготу по НДС и налогу на прибыль для резидентов Сколково. Чтобы сохранить одну льготу, нужно отказаться от другой.

Привели ставки налогов и взносов в 2026 году при выборе каждой льготы в таблице:

Поможем оценить возможность применения налоговых льгот

Комплекс налоговых льгот зависит от системы налогообложения участников Сколково. Так, резидент может не платить налог с прибыли, если применяет ОСНО. Для получения максимальной выгоды требуется предварительно рассчитать налоговую нагрузку и оценить потенциальные риски.

Чтобы воспользоваться всеми преимуществами резидентства в Сколково, нужно изначально проработать различные финансовые сценарии. Самостоятельно сложно учесть все факторы, можно допустить ошибки. Специалисты 1С-Wiseadvice помогут разработать налоговую стратегию — мы рассмотрим возможность применения налоговых льгот и пониженных тарифов конкретно для вашего бизнеса и поможем подтвердить их.